Sotax egna mjukvara WinSotax ger total kontroll över system samt systemtillbehör. Uppbyggt i enlighet med regler för 21 CFR Part 11 ges möjlighet till elektronisk registrering och validering samt elektronisk signering av data. Samtliga händelser loggas i Audit trail-filer. WinSotax kan styra ett flertal fotometrar bl.a. Shimadzu och Thermo. Finns även i Client-Server version; WinSotax Plus.